En terme d'innovation, la Suisse est un pays extrêmement compétitif. La répartition des tâches entre les secteurs public et privé dans ce domaine s'est développée au fil du temps et repose sur trois piliers de la politique suisse : le principe de subsidiarité, la liberté et l'indépendance de la recherche ainsi qu'un système économique libéral. Une intervention active de l'État requiert un mandat constitutionnel explicite. Les institutions étatiques de tous les échelons veillent à la création d'un terrain fécond pour l'innovation.
La Confédération et les cantons se partagent les compétences règlementaires dans les domaines de la recherche et de l'innovation, notamment en ce qui concerne les transferts de savoir et de technologie, les start-ups, la politique régionale et la promotion économique. La CDEP assure la direction politique de projets, joue un rôle de coordination intercantonale et est l'interlocutrice de la Confédération (p. ex. le projet de Parc national d'innovation).